キャリーの中でうさちゃんが見せる行動は、やはり個体差によって違ってきます。メッシュのすのこもついたキャリーをご利用ですと、うさちゃんが排泄しても体が汚れにくい状況です。普段使用しているトイレもすのこがついたタイプであれば、同じような環境といえるでしょうから、そう抵抗なく使ってくれるのではないかと思います。それでも我慢しているということは、うさちゃんの縄張り意識が強く、トイレはいつも使っている決まったところだけ、キャリーの中ではトイレはしないと決めているのかもしれません。
また、普段とは異なる場所へのお出かけ中ですので、周囲を警戒している様子もあると思います。キャリーによっては周囲から見える状態もあると思いますので、うさちゃんが落ち着かなくトイレの体勢を取ることができないことも考えられるようです。落ち着ける場所である自分のケージの中に戻って、安心してトイレを使うといううさちゃんの気持ちにも納得できるようではないでしょうか。こちらのうさちゃんだけではなく、お出かけ中はおしっこしない子も少なくないようです。
もし布類を引っ張っていたずらしないうさちゃんであれば、カバーなどを使用した場合では過ごし方が変わるのかどうかを観察いただくことはできると思います。試してみてください。