あおいろ様もご心配ですよね。先天的な不正咬合ということのようで、前歯（切歯）を治療されているようですが、奥歯（臼歯）の様子はいかがだったのでしょうか。よだれがでたり、絶えず口をもごもごしているような様子は、あおいろ様がお考えのように臼歯などの歯に問題があるのではないかとも考えられます。また目やにや涙といった症状や、目に生気がないといった状態も、普通では見られない様子でもありますから、原因がなんであるか、再度獣医師にご相談して、じっくりお聞きになることがよいかもしれませんね。
うさぎの歯は、常に変化していると理解して、出来れば獣医師にその様子をみせてもらうとよいかもしれませんね。そしてその上で獣医師と一緒に、今後のケアや食事内容などを決めていって欲しいと思います。