トイレ以外の場所でも、その場所が一か所に決まっているということですので、確かに縄張りを主張しているための糞ということではないと印象をお受けします。牧草を食べる時にと想定できる場所でもありますが、食べながら排泄することもうさぎには多いのです。特に糞についてはそれが当てはまるともいえると思います。ただ、これまではこの行動が見られなかったということですので、うさぎさんからしてみれば、そうする状況が生まれてきているといえるのではないでしょうか。環境の変化として、お留守番が増えたということがあるようですので、たとえその時間が短くとも、「ひとりにさせて」といううさぎさんからの仕返しなどの気持ちが含まれていたりするのかもしれませんよ。帰って来た時に顕著に見られるようですからね。この行動に対しての飼い主さんの反応なども、きっとうさぎさんはしっかり観察しているのだと思います。お留守番ではない場合でも見られるようならば、その時のうさぎさんとうさぎさんを取り巻く環境（飼い主さんの行動も）をよく観察してみていただくとよいでしょう。ただ単に食べながら出てしまっているということなのか、それが習慣になっているのか、または意味のある行動なのかということを考えてみていただきたいと思います。