そうですね、うさぎさんにとっても是非健康診断は定期的に受けていただきたいと思います。そのことにより、体調管理や、病気の早期発見にも繋がることですので、とても大切なことですね。
通院に対してのストレスは、少なからずありますよね。そのストレスをいくらかでも軽減してあげることが必要となってくるのだと思います。電車にしても、車にしてもよりよい環境を考えてあげるとよいと思いますよ！
電車の場合は、所要時間が短くなるようですので、これは利点ですよね！雑踏の中にさらされてしまいますので、うさぎさんから景色が見えないような工夫や、混雑時などを避けた通院スケジュールを考えるとよいと思います。
車の場合は、個室と考えられますので、飼い主さんと一緒という印象を与えられるとも考えられますし、交通機関とは違って乗り換えなどでの気温の変化もあまりないとも考えられるかもしれませんね。ですが電車よりも揺れを直接感じられるともいえますし、道路事情によっては到着時間が読めない場合もでてくるかもしれません。
それぞれよい悪いがあるかと思いますので、こればかりはよくよく考えて判断いただきたいと思います。また今からの暑い時期は、通院のストレスに合わせて、暑さなどの環境に対してもストレスが増加するとも考えられます。モモのバーバ様もおっしゃるように、近くの獣医師さんで診ていただくというのも、ひとつの方法だと思います。そして気候が安定した時期に、よりうさぎに強い獣医師に、しっかりと診ていただくということでもよいと思いますよ。